bitFlyer 由前高盛衍生品和债券交易员 Yuzo Kano 于 2014 年创立。bitFlyer 的加密货币交易所于 2014 年 4 月推出，几个月前曾经占据市场主导地位的比特币交易所 Mt. Gox 倒闭。 2018 年，在日本监管机构指责该交易所未采取行动阻止洗钱和恐怖主义融资后，该交易所停止接受新客户。监管机构表示，大多数董事都是前高盛交易员、首席执行官 Yuzo Kano 的朋友。到 2016 年 2 月，它拥有 100,000 名用户，每月处理约 70 亿日元（6400 万美元）的加密货币交易，使其成为日本最大的比特币交易所。它在三轮融资中筹集了约 3600 万美元的风险投资。该公司与零售商、移动应用程序公司和支付处理器建立了合作伙伴关系，以促进零售地点基于智能手机的加密货币支付。[bitFlyer 还获得了监管部门的批准，可以向机构出售加密货币投资者。
bitFlyer 于 2017 年 11 月在国际上扩展到美国，并于 2018 年 1 月扩展到欧洲。到 2018 年，该公司在日本处理了 80% 的比特币交易，并已发展到 150 名员工。 2018 年，bitFlyer 是被要求改进其反洗钱程序的六家交易所之一，导致 bitFlyer 在实施新系统时暂停服务。
2019 年，bitFlyer 创建了一家专注于区块链技术和服务的子公司。